Linux 上非 root 用户 Conda 编译安装 ISCE2(含 RelaxIV 、GPU 加速等全部可选项,2023年4月8日更新)

今天演示一下 Linux 上非 root 用户 Conda 编译安装 ISCE2(含 RelaxIV、GPU 加速等全部可选项)。本文的演示环境是 Nvidia A100 GPU 云服务器、Ubuntu 18.04 Linux、Miniconda3 版本 conda 23.3.1、ISCE2 2.6.1。分为 ISCE2 编译安装和简单测试两部分。

重要提示:isce2 这款软件对各组件的版本特别敏感,conda 默认会安装有效的最新版本,导致 isce2 安装失败。本文已于 2023年4月8日更新了 isce2 编译运行所需要的 Conda 环境安装方法,所以视频中的Conda 环境安装部分已经过时。本文的首发网址为:学习日记 https://www.learndiary.com/2022/08/linux-conda-isce2/ 。若有更新会第一时间发布在首发网址中。

视频演示地址:https://www.bilibili.com/video/BV1La411o785?share_source=copy_web&vd_source=d1925b070926f23b2b6676137251e9ea

提示:本演示视频分为“编译安装”和“简单测试”如下两部分:

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Linux 下非 root 用户 Conda 安装生物信息 R 软件包 CellMix 演示

今天演示一下 Linux 下非 root 用户 Conda 安装生物信息 R 软件包 CellMix,CellMix 是一款 9 年前就停止更新的老旧生物信息 R 软件包,但是却有人仍然需要使用它。由于年代久远,官网上的安装方法在现在的较新的 R 版本环境下已经失效,给安装带来相当的难度。本文的演示环境是位于腾讯云广州区的 Debian 10 Linux 云服务器、Miniconda3 版本 4.12.0、R 4.0.2、CellMix 1.6.2。视频演示地址:https://www.bilibili.com/video/BV16U4y127AS?share_source=copy_web

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